プラグインの「SFTP」を使ってやります。インストール方法とかはこのサイトに書いているのではじめに入れておきましょう。
設定はここから

下線と赤枠のところを書き換える

リモートとローカルのファイルの整合性を取るため、どっちかやっておきます

編集したファイルをアップするショートカット

Ctrl+Alt+u →(のあと直ちに) f

やってられないので、キーバインドを[Ctrl+Alt+s]に変更します。

この一行をコピー

こっちに貼り付けます

サブフォルダのファイルもちゃんとリモートのサブフォルダに保存できます

別のフォルダを別のサーバーに繋ぐ設定も別ファイルに保存できます

今から作るのは別のサーバの設定